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孔雀鱼繁殖时需要将水温控制在26℃，保证水质干净、无污染，保持环境安静。雌性鱼发情时，腹部会臌胀，而雄性鱼会一直追逐雌性鱼，直到交配成功。交配好的鱼需要分开养殖，避免受精后的雌性鱼继续与雄性鱼交配。孔雀鱼是体内受精，卵胎生，胎斑变黑时，其肛门会凸起，随后产卵。
孔雀鱼容易辨别雌雄。雌鱼腹部比较大，在肛门前方有一块透明的胎斑，在快生殖的时候胎斑成黑色。
雄鱼的特点就是腹部较小，瘦长，最关键的就是其臀鳍演变出交接器，用于繁殖时候输送精子用。所以雄鱼的臀鳍前方的几根鳍条比较粗大。而雌鱼的臀鳍则是均匀的。
孔雀鱼繁殖不分季节，即使是冬季也能正常生产。孔雀鱼的繁殖周期在环境允许的条件下，约一个月可以繁殖一次，且每次可产10-120尾仔鱼，一年产仔量相当多，因此也有“百万鱼”之称。