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西瓜花是黄色的。西瓜花别称夏瓜花、寒瓜花，为单性花，雌雄同株。人工辅助授粉十分必要。翌日开放的雌花和雄花用纸筒套住，第二天早上开花时，取下纸筒进行人工授粉。雌花由花瓣、柱头、子房组成，柱头有蜜腺，为虫媒花，是典型异花授粉作物。西瓜为雌雄同株异花作物，单性花。但也有部分品种的部分雌花能发育成雌型两性花。
西瓜的花为单生，着生在叶腋，雄花着生比雌花早，一般自主蔓第3节开始着生，除着生雌花节位外，其余各节均可着生雄花。雌花着生位置与品种熟性有关，早熟品种自主蔓第5~7节开始着生，中熟品种自主蔓第7~9节开始着生，晚熟品种开始着生在主蔓第10~11节以上。雌花开始着生后的间隔节位一般为3~5片叶或7~9片叶。雌花的柱头和雄花的花药均有蜜腺组织，为典型虫媒花构造。
西瓜的花器开始分化早，一般子叶出土后已开始进行，出苗后25~30天完成花芽形成分化。西瓜的第4片真叶展开前后为适宜坐果节位的雌花分化形成期。这一阶段的环境条件对雌花形成节位和雌雄花比例影响很大。一般适当低温，尤其是夜温较低有利于雌花形成。充足的光照、适宜的温度和良好的植株营养条件都有利于雌花形成。