大地爱好者番茄幼苗种子发黄一般是西红柿缺镁的症状，属于一种生理性病害，容易被当做一种细菌性病害。
西红柿幼苗的这种病害，也可能是由于土壤温度低，湿度大引起的生理性沤根现象，这样也就导致了地上的叶片发黄。当然也可能是缺肥引起的叶片发黄，但这种情况下，土壤中并不缺乏镁元素，就是由于植株根系对养分吸收差，或对营养元素的利用率不高，从而出现这种情况。另外，出现这种情况也与连年重茬、施肥不当有关，如施用不腐熟的有机肥造成烧根，及长期连续施用或过量施用化学肥料造成土壤板结，土壤中盐离子浓度过高导致根系生长差，营养不协调有关。
除了这种情况，也有可能是立枯病和猝倒病，这两种疾病是危害番茄生长最常见的疾病，表现出来的特点也有叶面、幼苗发黄等情况，需要及时施药补救，避免影响产量。