1、种类不同:云南红豆杉是裸子植物门、红豆杉科、红豆杉属植物。南方红豆杉是木贼门、红豆杉科、红豆杉属植物。2、高度不同:云南红豆杉高达20米。南方红豆杉高达30米。3、胸径大小不同:云南红豆杉胸径达1米。南方红豆杉胸径达60~100厘米。
云南红豆杉分布于中国于云南西北部及西部(镇康、景东),四川西南部与西藏东南部,不丹、缅甸北部也有分布。生于海拔2000~3500米高山地带。
南方红豆杉是中国亚热带至暖温带特有成分之一,在阔叶林中常有分布。耐荫树种,喜温暖湿润的气候,通常生长于山脚腹地较为潮湿处。
南方红豆杉。自然生长在海拔1000米或1500米以下的山谷、溪边、缓坡腐殖质丰富的酸性土壤中,要求肥力较高的黄壤,黄棕壤,中性土、钙质土也能生长。耐干旱瘠薄,不耐低洼积水。