毛曼陀罗和曼陀罗在高度上有所差别,毛曼陀罗是一年生的直立草本植物,株高1~2米,毛曼陀罗全身分布着白色的短毛,曼陀罗是茄科一年生的草本植物,株高0.5~1米,全株较为光滑。
毛曼陀罗和曼陀罗在花朵上也有所不同,毛曼陀罗的花朵单身于枝条上,初期呈直立状,后期会向下弯曲,近似喇叭形。毛曼陀罗的花朵下部分带有淡绿色,上部呈白色,曼陀罗花朵下部呈绿色,上部分呈白色或淡紫色。
毛曼陀罗和曼陀罗在叶片上也有所区别,毛曼陀罗叶片呈广卵形,长10~18厘米,宽4~15厘米,叶片上带有7~10天侧脉,曼陀罗叶片长8~17厘米,宽4~12厘米,叶片上有3~5天侧脉。
毛曼陀罗和曼陀罗的花果期叶有所区别,毛曼陀罗会在每年6~9月开花,曼陀罗在每年6~10月份开花,果期在每年7~11月份。此外,毛曼陀罗的根茎较为粗壮,曼陀罗下部根系较为细长。